水性涂料和有机溶剂涂料在有些地方是相似的。但是在有些情况下，水性涂料经常要面对一些在有机溶剂涂料没有的困难。这两种体系的最大差别在于成膜过程中挥发物的连续相的逐渐消失机理的不同。而成膜过程又对涂料的最终性能有很大的影响因而在受到极大的关注。

  1、水性涂料中的水有很高的沸点因此挥发过程十分缓慢，强烈的依赖与环境的湿度。在低湿度情况下，它可能干燥的很快有时会引起裂缝。在高湿度情况下（如热带国家尼加拉瓜湿度经常达到78－85％），成膜过程将十分缓慢造成涂料的松垂。需要更多的能量使其干燥，甚至是溶剂型油漆的四倍因为水的比热较大。

  2、水性涂料对施工过程中及材质表面清洁度要求高，因水的表面张力大，很不容易侵润，易使涂膜产生缩孔。在油脂性表面这个问题尤其突出。

  3、水性涂料对抗强机械作用力的分散稳定性差，输送管道内的流速急剧变化时，分散微粒被压缩成固态微粒，使涂膜产生麻点。要求输送管道形状良好，管壁无缺陷。

  4、水性涂料对涂装设备腐蚀性大，尤其是对铁制设备的锈蚀。经常需采用防腐蚀衬里或不锈钢材料，设备造价高。水性涂料对输送管道的腐蚀，金属溶解，使分散微粒析出，涂膜产生麻点，也需采用不锈钢管。

  5、烘烤型水性涂料对施工环境条件（温度、湿度）要求较严格，增加了调温调湿设备的投入，同时也增大了能耗。

  6、水的蒸发潜热大，烘烤能量消耗大。阴极电泳涂料需在180℃烘烤；而乳胶涂料完全干透的时间则很长。

  7、沸点高的有机助溶剂等在烘烤时产生很多油烟，凝结后滴于涂膜表面影响外观。

  8、水性涂料形成的涂料层常常对水是敏感的，即使空气中的水蒸汽含量的增加就会引起涂料的褶皱。

  水性涂料虽然存在诸多问题，但通过配方及涂装工艺和设备等几方面技术的不断提高，有些问题在工艺上得到防止，有些通过配方本身得到改善和提高。